一个多世纪以来，蛋白胨作为培养基中主要的营养组分而广泛使用。蛋白胨包含肽类、氨基酸、微量元素以及能作为生长因子或辅助因子的其它微量营养素，促进细胞增殖及生产。

蛋白胨的起始原料包括肉类、干酪素和乳清（乳品蛋白）、明胶、大豆、酵母和谷物。通常根据蛋白质来源的不同，将蛋白胨分为三类：动物蛋白胨、植物蛋白胨、微生物蛋白胨。每一种蛋白胨产品都有其特性，源于起始蛋白质原料的来源和质量、酶的来源和质量、制造该种蛋白胨的水解方法。

国内的动物蛋白胨主要有牛骨蛋白胨、猪骨蛋白胨、鱼粉蛋白胨等，且以牛骨蛋白胨的使用为广泛。骨胨是以动物骨头中的胶原蛋白为原料，酶解得到的蛋白水解物。胶原蛋白是一种纤维蛋白，其结构的氨基酸序列非常有特点，一般以 -甘氨酸-脯氨酸-羟脯氨酸- 三联交替出现的顺序排列，因此富含甘氨酸和脯氨酸，尤其是甘氨酸的含量，占总氨基酸残基的20以上。

植物蛋白胨以大豆蛋白胨为主，大豆蛋白属于完全蛋白，氨基酸组成，但甲硫氨酸含量较低。同时大豆富含B族维生素。大豆蛋白胨在氨基酸组成和比例、B族维生素含量上接近另一种蛋白胨——酵母蛋白胨。

近年来，随着时有爆发的动物疫情、新型动物病的层出不穷，动物来源的原料越来越受到严格控制，新型发酵产业面临着一个大的发展趋势：使用非动物源产品进行培养基组分替代。而其中，对大豆蛋白胨的选择和需求日益增多，国内特别是从事医药原料、生物医药产品发酵生产的企业，逐渐都在使用大豆蛋白胨来进行原有产品的替换。